«Hajduk» je 19. i 20. kolovoza 2006. godine uveličao proslavu 50. godišnjice «Moslavine» iz Velike Trnovitice, osvojivši uvjerljivo prvo mjesto  na prigodnom dvodnevnom turniru, svladavši u finalu domaću «Moslavinu» rezultatom 7-3.
Treće mjesto osvojila je «Mladost» iz Nove Ploščice svladavši «Lastu» iz Palešnika 5-1.
Ovom prilikom domaćin je otvorio novouređene klupske svlačionice i prostorije.
Prvoga dana turnira «Hajduk» je bio bolji od «Laste» 4-0, a «Moslavina» od «Mladosti» sa 5-3.
Iako su ovaj jubilej domaćina trebali uveličati i veterani zagrebačkog «Dinama», isti se nisu pojavili već su svoj nastup otkazali u posljednji trenutak. Kao dostojna zamjena uskočili su veterani «Hajduka» koji su bili bolji od domaćina «Moslavine» sa 2-0. 

Novo prvenstvo u Prvoj županijskoj nogometnoj ligi Bjelovar, čiji je «Hajduk» član neprekidno od njenog ustrojavanja, dakle punih 13 godina, starta utakmicama prvog kola 03. rujna 2006. godine. Od ove sezone broj klubova je smanjen sa 14 na 12 uslijed ustrojavanja nove 4. hrvatske lige.

U prvom kolu se sastaju:

Nogometaši «Hajduka» pripreme za novu natjecateljsku sezonu 2006/2007. započeli su 15.07.2006. godine. Trener Tihomir Pokopac na raspolaganju ima 20-tak uglavnom domaćih igrača, koji su dres kluba nosili i tijekom prošlogodišnjeg prvenstva. Osim tri treninga tjedno «Hajduk» će odigrati i 8 pripremnih utakmica s klubovima s kojima se ne sastaje u prvenstvu.

Raspored pripremnih utakmica:

Dana 24.07.2006. godine u Hrvatskom seljačkom domu u Hercegovcu održan je Plenum klubova Prve županijske nogometne lige Bjelovar uoči početka natjecateljske sezone 2006/2007. Domaćin ovoga Plenuma bio je NK «Hajduk» iz Hercegovca. Na plenumu su nazočili predstavnici svih 12 klubova 1. ŽNL-e i tom su prilikom određeni natjecateljski brojevi za prvenstveno natjecanje:

Želeći nastaviti tradiciju odigravanja prijateljskih utakmica s uglednim hrvatskim prvoligašima «Hajduk» je uputio poziv NK «Zagrebu» i njihovom treneru Miroslavu Ćiri Blaževiću da tijekom jeseni ove godine gostuju u Hercegovcu i odigraju prijateljsku utakmicu protiv našeg Kluba.
Podsjećamo, «Zagreb» je već jednom gostovao u Hercegovcu, ali bilo je to davnih 70-tih godina prošlog stoljeća.

U subotu, 17. lipnja 2006. godine dugogodišnji igrač i kapetan «Hajduka» TIHOMIR POKOPAC okončano je svoju aktivnu nogometnu karijeru koja je trajala punih 18 godina. Tom prilikom «Hajduk» je svome legendarnom igraču priredio oproštajnu utakmicu u kojoj su se sastale aktivna momčad «Hajduka» i selekcija «Tiho i Prijatelji» koju su činili igrači i Tihomirovi prijatelji iz «Zdenke», «Garića» i veterana «Hajduka». Selekciju je vodio poznati trener Vlado Hodžić. Utakmica je završila rezultatom 4-3 za «Hajduk».
Cjelokupan prihod od prodaje ulaznica sa ove utakmice doniran je u dobrotvorne svrhe Dječjem vrtiću «Maslačak» iz Hercegovca za kupnju igračaka i druge opreme. Poslije utakmice u klupskim prostorijama pred 100-tinjak gostiju premijerno je prikazan 25-minutini dokumentarni film «Tihomir Pokopac – nogometna karijera», koji je nastao u produkciji NK «Hajduka», a govori o bogatoj nogometnoj karijeri nove Hajdukove legende Tihomira Pokopca.
Tihomir Pokopac je za «Hajduk» odigrao ukupno 437 utakmica, pri čemu je postigao 272 pogotka.

Članovi klupske Uprave potpomognuti ostalim članovima Kluba i igračima neprestano uređuju i nadograđuju klupske prostorije koje se nalaze neposredno uz travnjak igrališta u samome središtu Hercegovca.
Tako je krajem 2005. godine u potpunosti zamijenjeno 524 m2 starog krova iznad klupskih prostorija novim krovom od pocinčanog trapeznog lima, a koja je investicija iznosila oko 30.000,00 kn. Pomoć u izvođenju radova svojim donacijama pružili su, između ostalih, i Hrvatski nogometni savez, Općina Hercegovac i Bjelovarsko-bilogorska županija, te mnogi klupski sponzori.
Inače, sanacija staroga krova bila je neizbježna, obzirom da je isti bio oštećen uslijed elementarne nepogode, odnosno strašnog olujnog nevremena koje je zahvatilo Hercegovac i okolna naselja.

U utorak, 11.listopada 2005. godine u Hercegovcu je gostovao još jedan ugledni hrvatski prvoligaš – NK «Varteks» iz Varaždina. Pred oko 400 gledatelja varaždinski prvoligaš predvođen trenerom Zlatkom Dalić, odradio je vrlo dobar nastup, te svladao domaći «Hajduk» rezultatom 4-0.
Na ovoj utakmici od aktivnog igračkog staža oprostio se «Hajdukov» igrač Josip Lučan.

U razdoblju od 01-03. srpnja 2005. godine seniorska momčad NK «Hajduka» gostovala je na trodnevnoj turneji u Češkoj, u sklopu koje je u mjestu Jirice u Miroslavi, nedaleko Brna, odigrala prijateljsku međunarodnu utakmicu s TJ «Družstevnikom», koji je slavio 60. godišnjicu postojanja.
Ova utakmica odigrana je u sklopu nastavka dugogodišnje sportsko-prijateljske suradnje između spomenuta dva kluba, koja traje već skoro 40 godina.
Utakmica je protekla u terenskoj nadmoći «Hajduka», koji je pogotcima Čajse, Barića, Bičeka i Farkaša, pobijedio rezultatom 4-1.
Za «Hajduk» su nastupili: Farkaš F, Starešinčić, Stankić, Biček, Markić, Sokolić, Barić, Cjetojević, Čajsa, Pokopac, Farkaš I, Kučinić, Vojković, Kos, Doležal, Marinković, TRENER: Tihomir Pokopac.

NK «Hajduk» Hercegovac po drugi se puta u posljednjih šest godina našao u završnici Hrvatskog kup natjecanja među 48 klubova u Hrvatskoj, što za klub predstavlja najveći rezultat u povijesti.
U utorak, 30.08.2005. godine u Hercegovcu je odigrana utakmica pretkola Hrvatskog nogometnog kupa za sezonu 2005/2006. u kojoj su se sastali NK «HAJDUK» iz Hercegovca i NK «ZET» iz Zagreba. Nakon posrtanja u pretkolu prije šest godina u Buku, Hajduk niti ove godine nije uspio izboriti prolaz u prvo kolo. Utakmica je završila pobjedom trećeligaša ZETA rezultatom 3-1.

U nedjelju, 26. rujna 2004. godine u Hercegovcu je gostovao prvak Hrvatske HNK «Hajduk» iz Splita, koji je u najjačem sastavu odigrao prijateljsku utakmicu protiv seniorske momčadi «Hajduka» iz Hercegovca. Ova spektakularna i najveća utakmica u povijesti našeg Kluba završila je pobjedom splitskog imenjaka rezultatom 7:0, a nazočilo joj je oko 800 gledatelja. Splitski «Hajduk» predvodili su trener Blaž Slišković, sportski direktor Igor Štimac, dopredsjednici kluba Mirko Klarić i prof.Vinko Bajrović, a kao gledatelji utakmici su bili nazočni poznati hrvatski košarkaš Stojko Vranković i svjetski putnik (globtroter) Mate Lončar.

U sklopu središnje manifestacije obilježavanja 80. godišnjice postojanja Kluba pod nazivom «Veliki dani Hajduka» u razdoblju od 27.06. – 01.07.2003. godine u Hercegovcu je održan Nogometni turnir limača «Trofej Hajduka 2003», Međunarodni turnir seniora «Hercegovac 2003», te je odigrana prijateljska humanitarna utakmica izmedu Veterana Hajduka i Nogometne reprezentacije Hrvatskog sabora.
Utakmica sa Nogometnom reprezentacijom Hrvatskog sabora znacila je mnogo više od sportskog susreta, obzirom da je imala humanitarni karakter. Ovo je bila 48. utakmica reprezentacije Hrvatskog sabora, koju nije nimalo jednostavno ugostiti, kojom prilikom je Hercegovac istovremeno posjetilo čak 9 saborskih zastupnika (Canjuga, Mateša, Tušek, Radić, Fabijanić). Spomenimo i rezultat koji je glasio 2:1 za reprezentaciju Hrvatskog sabora.